Sugeng Bahagijo adalah anggota Badan Pengurus The PRAKARSA. Ia menjabat sebagai Direktur Eksekutif INFID/International NGO Forum on Indonesian Development (2012-2023). Ia pernah menjadi penasihat kebijakan untuk lembaga pemerintah Indonesia, yaitu Kementerian Perencanaan Pembangunan Nasional, Kementerian Koordinator Bidang Kesejahteraan Rakyat, dan Kementerian Ketenagakerjaan. Selain itu, ia juga pernah menjabat sebagai anggota Komite Pengarah di Open Government Partnership (OGP) dan sebagai anggota Komite Pengarah Asia Democracy Network (ADN). Ia juga merupakan Peneliti di Universitas Katolik Louvain, Belgia, Fellow Tamu di Institute of Development Studies (IDS), Universitas Sussex, Inggris, dan Magang Peneliti di Human Rights Watch, New York.
